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2015年12月我公司建立的红球藻种质培育与虾青素制品开发国家地方联合工程研究中心经国家发展和改革委员会（发改高技[2015]3173号）批复成立，2016年1月下旬 ，云南爱尔发生物技术股份有限公司 “红球藻种质培育与虾青素制品开发国家地方联合工程研究中心”项目建设揭牌仪式在云南爱尔发公司隆重举行。
该工程研究中心依托单位为云南爱尔发生物技术股份有限公司、云南爱尔康生物技术有限公司、中国科学院海洋研究所、中国科学院海洋研究所分析测试中心、中国科学院实验海洋生物学重点实验室、国家海洋腐蚀防护工程技术研究中心、海洋生态养殖技术地方联合工程实验室。
目前该中心由6个平台组成：一是雨生红球藻藻种资源深度挖掘和高效利用研发平台；二是产业化生产技术集成及工程化验证平台；三是质量标准体系平台；四是健康产品及精细化产品研发平台；五是大型光生物反应器研制平台；六是技术服务中心平台建设。
围绕红球藻虾青素产业链条的关键科学技术问题，重点开展以下6方面的工作：
1. 红球藻藻种资源深度挖掘和高效利用（包括：藻种收集与采集、分子生物学研究、筛选培育、产业化适应性评价）。
2. 产业化生产技术集成及工程化验证（包括：高密度培养、生产自动化控制、虾青素高效提取、细胞破壁、产品纯化分离、系统工程化验证）。
3. 质量控制和标准化研发（包括：各类产业化辅料技术标准和检测控制标准、产业化生产的行业标准体系、产品行业和国家标准体系）。
4. 健康产品及精细化工产品研发（包括：开发保健食品、生物医学产品、食品添加剂及动物饲料等高值产品，拓展产品种类，满足市场需求）。
5. 大型光生物反应器研制（包括：程序化控制、气体交换体系、防腐关键技术、稳定性运转技术）。
6. 技术服务中心平台建设（搭建中心与企业联系桥梁，培养新兴产业群，开展检验和检测等技术服务）。